Ученые из Стэнфорда представили первые в мире вирусы, созданные искусственным интеллектом. Эти бактериофаги способны охотиться на устойчивые к антибиотикам штаммы кишечной палочки (E. coli) — и это лишь первый шаг к полностью искусственной жизни.
«Впервые ИИ-системы способны писать связные последовательности масштаба генома», — объясняет Брайан Хи, вычислительный биолог из Стэнфордского университета. Исследователи использовали модели Evo 1 и Evo 2, которые обучались на более чем 2 миллионах геномов фагов. В качестве шаблона выбрали простой вирус ΦX174 с 5 386 нуклеотидами в 11 генах.
Из тысяч сгенерированных последовательностей ученые отобрали 302 жизнеспособных бактериофага. Большинство кандидатов имели более 40% сходства нуклеотидов с исходным ΦX174, но некоторые получили совершенно другие кодирующие последовательности. После синтеза ДНК и экспериментального тестирования оказалось, что 16 из 302 ИИ-созданных фагов действительно могут заражать E. coli.
Самое интересное — комбинации искусственных фагов успешно инфицировали и уничтожили три разных штамма кишечной палочки, с которыми природный ΦX174 справиться не мог. «Это довольно неожиданный результат, который нас очень воодушевил, поскольку показывает потенциальную пользу метода для терапии», — отмечает соавтор исследования Сэмюэл Кинг.
Источник новости и обложки: www.nature.com